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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

鼓励春节不停产早复工 黄冈多个县市给企业发“红包”******

　　湖北日报讯（记者刘毅、通讯员刘勇）1月11日，拿着麻城市下发的一揽子开门红措施，湖北凤凰白云山药业有限公司经理成无瑕说：“订单比较多，再加上市里对企业对工人有专项补贴，我们今年春节不停产，预计1月份生产总值同比会有较大增长。”

　　近日，黄冈市多个县市出台政策，在本级财政预算中拨付300至500万元专项资金，对春节期间不停工或早复工的工业企业给予补贴，真金白银支持工业“开门红”。

　　考虑到企业春节开工增加的用工成本，武穴、红安、黄梅等地，按企业在岗人数给予每人每天100至150元的补贴。对企业最关心的生产要素，麻城、武穴、浠水等地对企业春节期间的用电用气费用，给予5%至10%的补贴。为鼓励员工就地过年或尽早返岗，武穴、黄梅、英山等地将奖励直接发放给留厂员工，或对提前返岗的外地员工报销路费。各地对不停工企业都安排了1万元的餐费补贴，帮他们在年夜饭上“加个菜”。英山对企业包车组织员工返岗的企业，给予包车费用补贴。为鼓励企业开足马力，该市多地对用电量和产值同比增长的规上企业将发出5万元到10万元不等的“大红包”。

　　今年，黄冈提出GDP增长7%的目标。为此，黄冈以“起步就是冲刺”的态度，采取多项措施，力争一季度全市规上工业增加值同比增长10％以上，规上工业总产值增速19.71%以上。

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）