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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

工信部：以开源方式加速操作系统生态共建逐步成为业界共识******

　　中新网12月28日电 题：工信部：以开源方式加速操作系统生态共建逐步成为业界共识

　　中新财经记者刘育英

　　中国工业和信息化部副部长王江平28日在操作系统产业峰会2022表示，当前开源引领新一代信息技术创新发展，以开源方式加速操作系统生态共建逐步成为产业界的共识。

　　王江平表示，开放原子开源基金成立两年以来，汇聚了各类的开源力量，着力推进欧拉、推进鸿蒙等优质操作系统的创新迭代、生态拓展和国际化发展，涌现出了一批典型的优秀案例，展现出了广阔的发展前景。

　　未来，推进国家软件发展战略，工信部将做好五方面工作：持之以恒攻关关键核心技术，增强操作系统等服务的供给能力；加强顶层设计，发挥开源基金会的主体作用，打造更加活跃的开源社区；深化融合运用，探索关键软件典型应用场景和最佳实践；强化人才供给，加强海外高端人才引进；不断推动开放合作，带动我国软件产业更高水平地融入全球产业生态圈。

　　中国工程院院士廖湘科在峰会上表示，近年来，中国对开源的认知及对全球开源的贡献正在悄然发生变化，正在从使用开源到参与开源再到现在的贡献开源，甚至主打开源，向世界贡献中国智慧。

　　openEuler(欧拉)作为一个支持多样性算力的开源操作系统，支持x86、Arm、RISC-V、LoongArch、SW64、Power六大处理器架构。华为常务董事 ICT基础设施业务管理委员会主任汪涛介绍，欧拉加速发展，社区企业成员从去年的300多发展到今600多，部署数量从100万套到今年累计300万套，新增市场份额占比约25%。欧拉正在跨越生态拐点，成为各行业数字化转型的首选。

　　开放原子开源基金会理事长孙文龙介绍，一年多以来基金会在商标托管、生态发展、开放治理等方面为 openEuler项目的发展提供了更好的平台。openEuler的快速发展证明充分利用开源、参与开源、支持开源、回馈开源是实现操作系统技术创新和产业繁荣的有效路径。(完)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）